相比二代3G版苹果iPhone，3GS首先在硬件配置上作了相应的提升，包括更高速的CPU以及升级至320万像素的摄像头等，其次在软件上直接使用了3.0的固件，支持彩信、文本复制粘贴、全盘搜索、录音等功能，性能优了大幅提升。
苹果iPhone 3GS在外观上与第二代苹果手机几乎没有任何差别，同样是镜面设计的大屏幕占据了正面，背面依然保留了弧形设计，显示出一种优雅的美感。手机配备了分辨率高达320×480像素的3.5英寸大屏幕，显示效果非常出色。
处理器方面改用了ARM Cortex A8的三星S5PC100处理器，主频升级至600MHz；内存从原来的128MB加倍至256MB，无论是开机速度、程序打开、软件运行都有大幅度的速度提升。
