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[时事]超级变种!新冠病毒携大量突变,传染力或超德尔塔

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11月26日,央视网发文称,南非国家传染病研究所在南非检测到一种新型新冠病毒变异株B.1.1.529。
冬季来临,天寒地冷,又到呼吸道传染病的高发季节。从10月下旬开始,全球的新冠肺炎感染数又呈现波动上升趋势。
11月25日,上海新增3例本土确诊病例,再次引发全国人民对新冠病毒的关注。而在地球的另一端,更坏的消息也传来了。
一、新变异毒株来袭
据媒体报道,南非国家传染病研究所在南非检测到一种新型新冠病毒变异株B.1.1.529,已在多个阳性病例中发现此变异毒株。消息一出,迅速引起全球科学家的关注。
专家指出,这种变异毒株带有大量突变,对于疫苗耐药性和疾病传播性来说是个不好的预兆。
目前,全球共有3个国家和地区确认出现了B.1.1.529阳性病例。尽管还没有发生大规模传播,但因为B.1.1.529出现了32处刺突蛋白突变,能帮助病毒逃脱免疫系统的监控,可能造成比德尔塔毒株更大的影响。

11月11日,B.1.1.529在非洲博茨瓦纳首次被发现;11月14日,南非出现第一个B.1.1.529感染病例,5个相关确诊病例。此外,中国香港也出现了1例感染病例,说明已有跨洲际传播的案例。
11月26日,南非国家传染病研究所与世界卫生组织召开紧急会议,并将变异毒株命名为Nu (Ν,ν),中文发音接近“牛”。
二、流行的可能性有多大?

新冠病毒的变异情况一直是各国专家的重点追踪对象,但没想到,这次居然憋了一个“大招”,引发各地专家的关注。
在香港确诊的病例是一名36岁男子,他于10月22日~11月11日在南非旅游,返回香港时核酸检测为阴性,但在隔离期间检测出阳性。11月22日,香港卫生署在GISAID上传了变异毒株的测序记录。随后,相似的记录开始出现在博茨瓦纳和南非。
11月23日晚10点,病毒学家Tom Peacock揪出了几个可疑毒株,并称“这是我见过的最糟糕的变种”;
11月23日晚11点,以色列卫生部中央病毒实验室的Shay Flesion整理出最早几例测序记录的演化树;


11月23日晚11点37分,Tom Peacock提交新毒株申请
11月24日凌晨4点,更多的相关测序记录陆续上线,可以看出大致的传播情况;
11月24日凌晨4点,斯坦福大学分子生物学家Georgi Marinov发现了部分相似的毒株;
11月24日下午5点30分,爱丁堡大学的Andrew Rambaut和剑桥大学的Christopher Ruis迅速走完了整个新毒株的命名流程(B.1.1.529)。这是史上最快的一次毒株命名,不到24小时就走完本需10天的流程。
世界卫生组织的反应也很快,11月24日晚上,B.1.1.529就入围了WHO VUM名单,并于26日将毒株重新命名为Nu (Ν,ν)。


这意味着,事态可能很严重。

桑格研究所Theo Sanderson表示,从测序记录来看,Nu毒株的流行率比较高。事实也证实了他的猜想。
数据显示,在南非,Nu毒株的感染占比呈直线上升的趋势,流行率突破75%,南非的大半江山已经沦陷,豪登省更是霸占了榜首。

图注:注意最右侧的蓝的部分


图注:上升速度比德尔塔快得多

Delta只有16处刺突蛋白突变,而Nu毒株却有32处,包括P681H和N679K两个点位,而在此前发现的毒株中,这两个位点从未同时突变过。这意味着,Nu可能是个传染力超强的变异毒株。
三、科学家:可能从艾滋患者体内进化而来

伦敦大学学院遗传学研究所所长Francois指出,此变异毒株有可能是在HIV患者慢性感染期进化出来的。实际上,相似的病例已经在6月份的南非出现了。
据报道,南非曾在一名36岁的晚期HIV女性患者体内发现新冠病毒突变。研究指出,她携带新冠病毒216天,期间,新冠病毒发生了32次突变,包括13次刺突蛋白突变。
遗传学家奥利维拉表示,这个病例很容易被忽视。最开始治疗时,她只出现轻微症状,没有引起重视。之所以她被发现携带变异病毒,是因为刚好参与了一项研究试验。也就是说,他们也不清楚这名患者是否已经将变异毒株传染给更多人。

美国波士顿传染病专家乔纳森指出,如果HIV感染者成为新冠病毒变异的源头,那么就会造成更加严重的后果。在HIV的加持之下,新冠病毒的传染力会更强,预防和治疗会雪上加霜。他说道;“我的一些担心有可能会变成现实。”
南非属于艾滋病高流行区,目前病毒学家正在密切关注疫情进展。对于我们而言,最重要的是做好预防,不要松懈,比如戴好口罩、注意个人卫生、家里经常开窗通风、外出时与人保持安全距离、及时接种新冠疫苗、积极锻炼身体等。
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我不喜欢说话却每天说最多的话,我不喜欢笑却总笑个不停,身边的每个人都说我的生活好快乐,于是我也就认为自己真的快乐。可是为什么我会在一大群朋友中突然地就沉默,为什么在人群中看到个相似的背影就难过,看见秋天树木疯狂地掉叶子我就忘记了说话,看见天色渐晚路上暖黄色的灯火就忘记了自己原来的方向。
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图:视觉中国
11月26日,西方传统的“黑色星期五”假日。世界卫生组织的一份紧急通报却为全世界带来了一个不好的消息。
两天前,南非上报了一组新冠病毒新变异株的基因序列。在召开紧急会议后,世卫组织将这一变异株迅速列为最高级别“需要关注的变异株”,并以希腊字母Omicron命名。
这是迄今为止第五个被世卫组织列入最高级别关注的变异株。
世卫根据变异株病毒的致病性、传播风险等特征分为三类:
需关注的变异株(Variants of Concern,VOC)
需留意的变异株(Variants of Interest)
进一步监测的变异株
其中最高等级VOC目前有四种毒株,包括眼下占全球传播90%以上的德尔塔(Delta)毒株。
为了防止Omicron毒株可能带来的巨大威胁,许多国家在一天之内宣布限制南部非洲国家的人员入境。
Omicron是否会超过德尔塔成为下一个主宰全球新冠疫情的毒株?
香港确认两例阳性病例感染新变异株
据最新消息,在南非等国最先发现的新冠病毒变异株Omicron(奥密克戎),目前已经在非洲以外的更多国家和地区传播。
香港特区政府卫生署卫生防护中心25日发布消息称,基因组测序证实,香港的2例阳性病例感染了Omicron(奥密克戎)变异株。其中一例为日前从南非入境香港,另一例或为在酒店隔离期间交叉感染。
香港卫生署卫生防护中心25日表示,专家到现场进行了视察,认为两人住的房间是同一层、房间正好面对面,病毒很大可能是经过空气传播,但相关证据还在调查当中。
传播速度惊人!
新变异毒株或已在美国境内
世卫组织在声明中指出,Omicron变异株包含大量突变,其中一些令人担忧。初步研究表明,与其他“需要关注的变异株”相比,该变异株导致人体再次感染病毒的风险增加,目前南非几乎各省份感染该变异株的病例数量都在增加。



而美国长期以来在新冠病毒基因测序方面缓慢进展,医学专家担心,新型新冠病毒变异株奥密克戎可能已经在美国境内传播。再加上近期美国迎来节假日出行高峰,民众大规模聚集活动增加,这些多重因素叠加,引发美国医学专家对美国疫情的担心。
另外有专家称,该变种病毒的威力很可能比现有的Delta 病毒更可怕。伦敦大学学院遗传学家巴洛克斯称,该变种可能从艾滋病患者体内进化而来。
医学专家担心新变异株或已在美国传播
最近两周,美国疫情数据已经出现明显的上升趋势。据美国疾控中心数据显示,截至25日,美国7天内日均感染病例数已达到94000例,较上月同期上升了47%。
此外,专家也担心,由于美国长期以来在新冠病毒基因测序方面进展缓慢,近期在南非等国发现的新型新冠病毒变异株Omicron(奥密克戎),很可能已经传播到了美国境内。
贝勒医学院教授彼得·霍特兹:我们在进行病毒基因测序这一程序中往往表现得缺乏行动力,所以如果说新的变异株已经传播到了美国,我完全不会感到惊讶。



变异毒株从哪里来?科研人员正在研究中
随着奥密克戎变异株传播范围不断扩大,科研人员也正在研究它究竟从哪里来。
英国伦敦大学学院生物学教授弗朗索瓦·巴卢分析称,Omicron(奥密克戎)变异株携带着一系列不寻常的突变,有可能是在某个免疫力低下病例的慢性感染期间发生的变异,也有可能来自某个未经治疗的艾滋病患者。
新变异株风险评估仍需更多实验数据
跟德尔塔病毒相比,变异毒株“奥密克戎”更大的危险性在哪里?是否会引发更大范围的传播呢?
据央视新闻援引今日俄罗斯电视台报道,目前,Omicron(奥密克戎)变异株正以惊人的速度在非洲和非洲以外地区传播。
以南非为例,近期南非豪登省90%的新增感染病例都与这一变异株有关。不少西方媒体认为,Omicron(奥密克戎)变异株是目前全球存在的最危险的新冠病毒变异株。
研究人员表示,去年10月在印度发现的德尔塔变异毒株,总共包含15处突变,世界卫生组织在今年5月将其列为“需要关注的变异株”;而根据初步研究发现,同样被世卫组织列为“需要关注的变异株”的Omicron(奥密克戎)变异株,比德尔塔毒株具有更多突变,目前已知该变异株携带的突变至少有32处,大量突变意味着可能会弱化现有新冠疫苗的效力,并且可能更具传染性。
世卫组织官员表示,目前对这一新型变异毒株还所知甚少,评估它是否更具有传染力或对疫苗更具有抗药性,仍需要更多实验数据。
70秒解读:
携带大量突变,或更具传染性


00:00/00:00[backcolor=url(&quot]
研究人员发现,新型新冠病毒变异株奥密克戎比德尔塔毒株具有更多突变,目前已知该变异株携带的突变至少有32处,大量突变意味着可能会弱化现有新冠疫苗的效力,并且可能更具传染性。世卫组织官员表示,目前对这一新型变异毒株还所知甚少,评估它是否更具有传染力或对疫苗更具有抗药性,仍需要更多实验数据。
来源:海外网·海客见闻
世卫要求各国加强监测和测序工作
目前世界卫生组织已经要求各国加强监测和测序工作。呼吁各国加强对所有仍在流行的新冠变异毒株的监测和测序,向公开数据库提交完整的病毒基因组序列和元数据,并向世卫组织报告与任何“需要关注”的变异毒株有关的初始病例或病例集群。
世卫组织还建议开展国际协作,通过实地调查和实验室评估,更好地了解“需要关注”的变异毒株各方面的影响。
担忧之处
为什么科学家们担心这个新变异株?
根据南非政府和世卫组织初步披露的数据,Omicron毒株共有多达50多处变异,其中在最受关注的刺突蛋白上有大约30个变异,多个关键变异可能导致病毒传染性和逃避疫苗免疫能力的大大增加。
奥密克戎变异株致
人体再次感染新冠风险增加
来源:人民视频
美国加州大学旧金山分校(UCSF)住院药剂师江剑刚对澎湃新闻表示:“这些变异告诉我们两个信息,一是这个变异株毒性很大,确实让专家非常担心。第二,整个世界对于预警方面有了很大的提高,这对于防疫来说是好事。”
多位专家指出,对于病毒变异株来说,突变的数量不一定意味着“质量”——数量多并不直接与病毒影响的严重性直接挂钩,关键是变异位点是否会对病毒的传染能力及免疫逃避能力产生影响。而后两者正是Omicron毒株引起专家重点关注的原因。
江剑刚指出,通过对其他变异株早前的研究,科学家已知Omicron中的一些突变点会使病毒更具传染性;一些突变会使病毒更容易逃避人体的免疫反应,另一些突变点则会削弱其抗体反应(由于先前感染或接种疫苗而建立的防御机制)。迄今为止出现在许多令人担忧的变异株上的特点都存在于Omicron毒株之中。



Omicron毒株同时存在3种类型的蛋白突变
图表由江剑刚提供
“最大的担忧是它可能比目前占全球主导地位的德尔塔毒株更容易传播。”金冬雁说,他强调眼下当务之急是加快对非洲地区病例的基因测序,搞清楚到底Omicron毒株在非洲的传播已经有多广泛,影响有多大。而不仅仅是采用精准度不够高的核酸检测(PCR)。“比较担心的是非洲医疗基础设施差,疫苗接种率又低,很多病例可能之前都没有经过测序测出来。”他补充道。
目前还不清楚Omicron是否将取代德尔塔。此前南非出现过同样令科学家们关注的Beta变异株,但它最终没有能够超过德尔塔。也没能在世界其他地区广泛传播。
最坏的情况是,如果Omicron超越德尔塔毒株,或将导致更大规模疫情的暴发,且比德尔塔暴发发生得更快且更难阻止。另一个重大担忧是,目前的新冠疫苗和药物对Omicron的效力是否会大幅降低,若如此则需要重新设计和生产。



Omicron的传染性很有可能超过德尔塔。
图表由江剑刚提供
不过这些只是基于从南非出现的Omicron病例早期数据中得出的潜在担忧。目前为止,还没有迹象表明这种变异会导致更严重的疾病。未来需要几周的时间才能弄清Omicron是否更具传染性,疫苗是否仍然有效。



图表由江剑刚提供
多国发现奥密克戎毒株感染病例
出台紧急措施
一些国家担心这一新型变异毒株会继德尔塔毒株后引发新一波凶猛疫情,截至目前,已有大约20个国家陆续发布或准备出台针对南部非洲国家航班和旅客的入境限制措施。
加拿大
加拿大政府26日宣布,从当天开始禁止在过去14天内到过非洲南部7国的外国人进入加拿大,并禁止这7个国家的航班进入加拿大。这7个国家包括南非、莫桑比克、纳米比亚、津巴布韦、博茨瓦纳、莱索托和斯威士兰。
加拿大卫生部长让-伊夫·杜克洛宣布了五项防控新变异毒株的措施。加拿大外交部将发布一项旅行警告,建议所有加拿大人避免前往非洲南部。
澳大利亚
澳大利亚卫生部长格雷格·亨特27日宣布,澳政府将实施额外的边境安全措施,其中包括暂停来自9个非洲国家的航班。新的安全措施还规定,如果不是澳公民或永久居民,在过去14天到过这些国家的人将暂时不能入境。
欧盟暂停往返7国航班
欧盟委员会主席冯德莱恩当天发表声明说,变异毒株可能会在几个月内传遍全世界。欧委会向欧盟各成员国提议,暂停欧盟与非洲南部7国以及其他有感染病例的国家之间的旅行。欧盟轮值主席国斯洛文尼亚26日晚在社交媒体证实,欧盟国家代表当天下午召开紧急会议,同意启动“紧急刹车”机制。
比利时
比利时卫生大臣弗兰克·范登布鲁克26日证实,该国确诊一例新型变异毒株感染者。这位确诊者有国外旅行史,11日到比利时,22日新冠病毒检测呈阳性。尽管这位确诊者并没有到过非洲南部地区,但当天比利时首相德克罗在全国协商委员会会议后宣布,比利时将很快按照欧盟委员会的建议,停飞往返非洲南部地区的航班。
以色列
以色列政府当天召开紧急会议,宣布非洲中部和南部地区所有国家为“红色区域”,禁止来自这些国家的人员入境,该决定立刻生效。
英国确诊病例达“千万级”
英国政府25日公布的疫情数据显示,该国新冠确诊病例累计已超过1000万例,成为继美国、印度、巴西之后又一疫情“千万级”国家。
英国是受新冠疫情影响最严重的欧洲国家之一。自9月中旬以来,单日新增确诊病例一直保持在30000例以上。
为预防新发现的变异新冠病毒B.1.1.529在英国传播,英国卫生大臣贾维德当晚在社交媒体推特上说,南非、博茨瓦纳等6个非洲国家将从26日起被列入“红色”警戒名单。来自这些国家的航班将从26日中午12时起暂停。
不过世卫组织周五批评了一些国家现阶段对非洲实施旅行禁令,该机构呼吁各国采取科学的方法实施防疫措施,避免草率地限制航班。
疫苗是否有效两周内揭晓?
新变异株引发了全球市场恐慌性暴跌。截至周五欧洲股市收盘,欧洲股指下跌超过3.7%,德国和法国股指分别下跌3.4%和4.4%,英国股指下跌3.2%。美国三大股指也延续跌势,收盘跌幅均超过2%。
疫苗企业股价暴涨。Moderna股价收盘大涨超过20%,拜恩泰科(BioNTech)股价也大涨超过14%,辉瑞股价上涨超过6%。
对于omicron变异株,上述新冠疫苗研发厂家在当地时间11月26日先后表示,正在研究毒株对疫苗的影响,部分厂家已经开始着手应对。
辉瑞:100天内可以开发和生产针对变种的疫苗
据媒体报道,当地时间11月26日,百欧恩泰(BioNtech,BNTX)和辉瑞(NYSE:PFE)称,已经启动mRNA新冠疫苗对omicron变异株的有效性进行评估,最晚两周内出结果。
辉瑞称:“如果出现疫苗逃逸变种,两家公司预计能够在大约100天内开发和生产针对该变种的特定疫苗,但需获得监管部门的批准。”
百欧恩泰方面强调,最新发现的变异株与之前观察到的变体显著不同,因为它在刺突蛋白中具有额外的突变。预计最迟在两周内获得来自实验室测试的更多数据。这些数据将提供更多关于该变异株的信息,是否需要调整现有疫苗。
莫德纳:三个层面同时推进
当地时间11月26日,莫德纳(Moderna, mRNA) 宣布针对B.1.1.529 (Omicron) 变体的解决战略,并表示公司正在迅速努力测试当前疫苗剂量中和 omicron变异株的能力,预计未来几周将提供数据。
莫德纳强调,如果目前授权的50微克mRNA-1273加强剂量被证明不足以增强针对 omicron变异株的免疫力,公司的应对策略包括三个层面。
第一,莫德纳已经在健康成人中测试更高剂量的mRNA-1273(100微克)增强剂的安全性和免疫原性。另外,美国国立卫生研究院 (NIH)也研究了100微克剂量的 mRNA-1273,结果显示对先前的新冠病毒株产生了最高的中和效价。莫德纳正致力于在中和试验中快速测试来自其高剂量加强剂接受者的血清,以确定 100 微克剂量的疫苗是否提供针对 Omicron 的卓越保护。
第二,莫德纳已经研究了两种多价增强候选疫苗,包括mRNA-1273.211和mRNA-1273.213,它们旨在预测突变,例如 Omicron 变体中出现的突变。前者已在 50 微克 (N=300) 和 100 微克 (N=584) 剂量水平下完成了 mRNA-1273.211 的潜在关键安全性和免疫原性研究的给药;后者已完成 100 微克 (N=584) 剂量水平的给药,并计划在大约 584 名参与者中探索 50 微克 剂量水平。
第三,莫德纳将迅速推进针对Omicron变体的候选产品mRNA-1273.529。
强生:正测试新冠疫苗对新变异株的有效性
强生(JNJ.US)在研新冠疫苗是腺病毒载体技术路线,属于单剂量接种。该疫苗已经在加拿大获得完全批准,在美国该疫苗已经获得加强针的紧急使用授权。对于变异株的应对,据福布斯商业网消息,强生在邮件中回应称,公司正在测试其新冠疫苗对 B.1.1.529 变体的有效性。
一位发言人写道:“我们正在密切监测新出现的omicron变异株,并且已经在测试其疫苗对在南部非洲首次发现的快速传播的新变种的有效性。”
阿斯利康:正研究变异株对疫苗和抗体组合药物的影响
在应对新冠肺炎疫情上,阿斯利康(AZN.US)除了疫苗,还有抗体组合药物。
对于最新出现的新冠病毒变异株,据环球新闻网消息,阿斯利康方面当地时间11月26日表示,正在研究在南非迅速传播的新型冠状病毒变种对其新冠疫苗和抗体组合药物的影响。
阿斯利康表示,公司正在博茨瓦纳和斯瓦蒂尼两个非洲南部国家进行研究以收集数据,这将使该公司能够针对这种变异毒株搜集真实世界数据。
此外,阿斯利康还表示,公司已与牛津大学合作开发了一个疫苗平台,以快速应对新变种,该疫苗平台是在牛津大学创建的。该公司此前曾表示正在研发一种变体疫苗,以更好地针对 Beta 变体。
诺瓦瓦克斯:已开始研究新冠疫苗的一个版本
诺瓦瓦克斯(Novavax,NVAX)11月26日表示,它已开始研究其新冠疫苗的一个版本,以针对在南非检测到的变种,并将在接下来的几周内准备好进行测试和生产。
诺瓦瓦克斯在研的新冠疫苗属于蛋白疫苗,目前已经在印度尼西亚、菲律宾等国家获得紧急使用授权,还在英国、澳大利亚、新西兰、加拿大等国提交了监管文件。此外,诺瓦瓦克斯还向世界卫生组织 (WHO)提交了紧急使用清单 (EUL),预计将在年底前向美国 FDA 提交完整的信息。
病毒发现过程
Omicron毒株出现的已知最早报告来自非洲。
据南非政府公布的信息,本周早些时候,南非新冠感染病例突然急剧增加,从每天新增确诊200多例飙升至11月25日的日增2465例。这些感染绝大多数发生在首都约翰内斯堡所在的豪登省。
起初,疫情暴发似乎与一个大型学生聚会的超级传播事件有关。但随着时间的推移,豪登省的新病例变得更加分散。这促使南非科学家进一步查看病毒样本的基因组序列。随后,科学家们发现了新的毒株B.1.1.529,最早的样本可追溯至11月9日。进一步分析证实,这种新变异株正在南非的许多其他省份快速传播。
11月24日,南非政府向世卫组织上报了这一新毒株的基因序列。几乎在同时,香港卫生当局在25日表示,香港已发现两例感染该毒株的病例。
香港大学医学院病毒学家金冬雁教授向澎湃新闻介绍道,香港发现的两例病例,其中一人是从南非返回香港。这名36岁的男子于11月11日抵港,当时在香港国际机场的核酸检测结果呈阴性,于11月15日在检疫酒店隔离期间被确诊。
仅仅3天后,同一间检疫酒店一名隔离人员亦确诊感染,两人的酒店房间为斜对面。全基因组测序分析结果显示,两起个案基因排序十分相似,均带有变异病毒株B.1.1.529。这两名患者均已接种两剂辉瑞新冠疫苗。
“这名36岁患者使用的是有呼气阀的口罩,无法有效地过滤呼出的飞沫微粒,易于传播病毒。该患者也承认,他在酒店取餐开房门时有一半时间没有戴上口罩,这可能导致有病毒的空气散播在走廊上。”金冬雁说。
香港卫生防护中心在该酒店采集的87份环境样本中,有25份被验出带有病毒。同时,11月11日至14日曾入住该确诊患者房间相邻三间房间的人员共计12人已被要求再次进行14天的强制检疫,暂时未发现相关确诊病例。
未来的挑战
只要新冠病毒不断传播,就会一直会发生变异,其中大多数的变异最终消失。而其中一些变异留存了下来,这种变异可能是在感染了病毒但不能清除病毒的人身上进化出来的,这给了病毒进行基因进化的机会。
专家们认为,这种情况类似于首个值得关注的变异株阿尔法变异(首次在英国发现)的情况,当时这些突变最早出现在一些免疫力低下的人身上。
金冬雁表示,此次Omicron为什么最早出现在南非,可能和该国多达400万的艾滋病人有关。新冠病毒在免疫力低下的人身上会不断进化和突变。
“这对所有国家都提出了警告:对于免疫缺损的病人和免疫力低下的人群,应该给予更多检测和额外的补助措施,例如打加强针,增强他们的免疫力,消除滋生变异株的温床。”金冬雁说。
Omicron毒株出现之际,正值全球多国开始尝试“与病毒共存”的政策,大幅放宽对接种疫苗者的入境限制,Omicron的出现,将会对这些国家的开放前景笼上一层阴影。
Omicron是否会构成更大规模的全球威胁还有待观察。让我们能稍许宽慰的是,许多国家已经开始采取措施,以争取时间为最坏的情况做准备,以达到最好的结果。与去年德尔塔出现时相比,世界各国这次会更有能力应对。
来 源 | 央视新闻、澎湃新闻、香港特区政府官网、海外网
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信誉值
30

只看该作者 13 发表于: 2021-12-01
路过飘过。