24日，姚明膝盖忽然出现疼痛，下半场离场。2月8日对阵森林狼，姚明被艾尔-杰弗森撞伤左肩；2月26日，姚明对阵开拓者时眉骨被撞到开裂，再次血流满面。
2009年5月4日，西部半决赛第1场，姚明在补防科比突破时，和飞侠正面撞击膝盖，痛声倒地。但是姚明在更衣室走廊和队医交流几句后决定重返赛场，坚持到最后；5月10日，姚明左脚踝受伤离场，证实为左脚骨裂，缺席剩余季后赛。7月22日，姚明成功接收骨裂修复手术。这一次，姚明整整缺席了一年，2009-10赛季出勤次数为0！
2010-11赛季：仅出战5场
2010年11月11日，火箭VS奇才的中国德比，姚明在第一节被麦基撞倒受伤，火箭宣布姚明左脚踝扭伤至少缺席一周，12月18日，火箭更新姚明伤情：左脚踝应力性骨折，正式宣布2010-11赛季报销；1月7日，姚明接受左脚踝手术，康复时间需要7-10个月。
