在古代，帕米尔高原被称为葱岭，在《山海经》中被称为布舟山。这是古丝绸之路的必经之路，也是最危险、最神秘的一条。
还有一首民歌概括了当地的气候：一二三雪封山，四五六雨淋头，七八九正好走，十冬腊月开头。
唐朝时，帕米尔属安溪度州，隶属于中国领土。
清朝时期，西北准噶尔山脉的古代部落逐渐强大起来，想要摆脱清朝的控制。帕米尔高原的塔吉克斯坦人也被准噶尔部控制，然后爆发力大小和卓之乱。
乾隆二十二年，乾隆出兵镇压。只花了两年时间就平息了大小和卓之乱，其首领都战死了。从那时起，帕米尔正式并入清朝，清朝派兵驻防。
然而，到了晚清，西方国家已经完成了工业革命，而清朝仍在闭关锁国，还在做着天朝上国，惟我独尊的美梦。鸦片战争最终打开了中国的大门，西方列强用鸦片叩响了旧中国的大门。
这时，俄罗斯在第二次鸦片战争后，占领了巴尔喀什湖东南部的伊犁河、塔拉塔河和古尔班马图。但当时的帕米尔高原还属于中国，由清朝统治。
1864年，清政府与俄罗斯签订了《中俄西北边界条约》，规定中俄边界为“以浩汉为界前往梁陵”，帕米尔仍属于中国。
但俄罗斯并不满意。1884年，俄罗斯与清政府签订《中俄续喀什边界条约》时，俄罗斯在帕米尔擅自将中俄边界从北部的阿来山划入高原东北部的乌兹贝山口，中国边界一直向南移动，留下一个三角形的“待议区“。
这样，帕米尔的所有权问题就留下了一个隐患。当然，在清政府作出回应之前，俄罗斯直接派遣军队占领帕米尔，然后英国军队进入中亚，两国将帕米尔一分为二。虽然清政府有意收复失地，但也是无能为力了。
这样，帕米尔高原就交给了其他国家，但中国政府并不承认帕米尔属于外国。
后来，以塔吉克为主要民族的帕米尔地区并入了苏联。1991年，苏联解体，塔吉克斯坦解体，宣布独立。帕米尔高原以前被俄罗斯占领，现在大部分变成了塔吉克斯坦的领土。
独立后，塔吉克斯坦为友好发展，主动与中国讨论中塔边境问题。
2010年4月27日，中国与塔吉克斯坦签署了《中塔边境线划界议定书》，规定塔吉克斯坦实际控制的1158平方公里领土划归中国。
到目前为止，经过128年，这片宝地已回归祖国的怀抱。此后，经过这一地区的发展，中国也发现了大量的资源，在这里有着很强的战略意义！
